Rui Alexandre é Ensaiador da Companhia Nacional de Bailado. 

Começou a exercer funções de ensaiador em 2010, ainda como Bailarino Solista, e sob a direção artística de Vasco Wellenkamp. Nesse ano foi assistente dos coreógrafos Vasco Wellenkamp, nos bailados A Chuva Cai na Poeira... e Lento para Quarteto de Cordas, Marco Cantalupo em Light, e Cayetano Sotto em A Sagração da Primavera. Remontou ainda a obra Savalliana, de Rui Lopes Graça.

Em 2011, sob a direção artística de Luísa Taveira, é promovido oficialmente a Ensaiador. Remontou o bailado clássico Romeu e Julieta de John Cranko, e foi assistente nas criações Du don de soi e Uma Coisa em Forma de Assim de Paulo Ribeiro , e Noite de Ronda, de Olga Roriz.

Em 2012, remontou A Bela Adormecida de Ted Brandsen, e deu assistência a Paulo Ribeiro na curta-metragem La Valse. Foi assistente de Olga Roriz na produção A Sagração da Primavera para a CNB. Nesse mesmo ano destaca a a sua participação enquanto assistente nas produções de Anne Teresa de Keersmaeker A Noite Transfigurada, Fauno e Grosse Fuge, coreografias que remontou nos anos seguintes.

Destaca ainda a sua experiência como assistente nos bailados O Lago dos Cisnes (Fernando Duarte); Orfeu e Eurídice, Treze Gestos de um Corpo (Olga Roriz), aqui também para a digressão internacional; Mozart Concert Arias, Grosse Fuge (Anne Teresa de Keersmaeker); Lídia (Paulo Ribeiro), com estreia no Teatro Camões, e com digressão internacional no México; Minus 16 (Ohad Naharin), O Pássaro de Fogo (Fernando Duarte), Carnaval (Victor Hugo Pontes), Quinze Bailarinos e Tempo Incerto (Rui Lopes Graça), juntamente com o artista plástico João Penalva, Dido e Eneias (São Castro e António Cabrita). Em 2018 foi assistente de Tânia Carvalho para a nova criação S, e trabalhou com Ambra Senatore para uma nova criação da coreógrafa para a CNB, Toccatta e Fuga.

Em 2023 ensaiou o bailado La Sylphide (Auguste Bournonville), nomeadamente os personagens de James e Gurn. Em 2024 remontou o Pas de deux do bailado Concerto Barocco (George Balanchine). 

Além de ensaios e remontagens de bailados, leciona aulas de Dança Clássica para a CNB desde 2014, e em 2017 lecionou Master Classes de Dança Contemporânea e Dança Clássica em várias escolas e teatros do país, durante as digressões nacionais da CNB.